A. 怎樣分析系統進化樹
問題一：如何讀懂進化樹 進化樹在生物學中，用來表示物種之間的進化關系。生物分類學家和進化論者根據各類生物間的親緣關系的遠近，把各類生物安置在有分枝的樹狀的圖表上，簡明地表示生物的進化歷程和親緣關系。在進化樹上每個葉子結點代表一個物種，如果每一條邊都被賦予一個適當的權值，那麼兩個葉子結點之間的最短距離就可以表示相應的兩個物種之間的差異程度。從進化樹中還可看出：生物進化有一個規律，都是從水生到陸生，從低等到高等，從簡單到復雜。
希望對你有幫助。
問題二：怎麼分析這個系統進化樹圖？有圖。求大俠賜教？ 10分 一個結點，從序列的進化關繫上就是一個新的物種。所以可以看出1-9在已鑒定的菌株中都未出現過，均為新物種。從進化的角度來分析。1,3,4,5,6,7,8,9屬於一個簇，進化關系比較接近。2和最下面的一簇物種比較接近。根據以上結果，可以進一步做生理生化鑒定，確認物種。
問題三：做了一個系統進化樹，請問怎麼分析 做了一個系統進化樹，請問怎麼分析
生物進化是指一切生命形態發生、發展的演變過程。「進化」一詞來源於拉丁文evolution，原義為「展開」，一般用以指事物的逐漸變化、發展，由一種狀態過渡到另一種狀態。1762年，瑞士學者邦尼特最先將此詞應用於生物學中。
簡介
生物進化是指一切生命形態發生、發展演變的過程。
生物進化樹
「進化」一詞來源於拉丁文evolution，原義為「展開」，一般用以指事物的逐漸變化、發展，由一種狀態過渡到另一種狀態。
最先將此詞應用於生物學中的是邦尼特。生物進化的基本單位是種群而非個體。
問題四：MEGA做出來的進化樹要怎麼分析 這個問題還是很easy的
MEGA 4
1.打開MEGA4軟體
2.在界面中選擇Alignment->Alignment Explorer/CLUSTAL
3.在彈出的窗口中選擇create a new alignment
4.彈出的窗口中點擊no用於蛋白質的分析
輸入序列什麼的就不說了
5.採用菜單欄Alignment中的Align by ClastalW
6.利用默認參數進行多序列比對
7.點擊Data菜單欄中的Exit AlnExplorer
8.點擊Yes保存current align session (.mas)及MEGA file(.meg)
9.我暫且認為你是要構建phylogeny，NJ(neighbor joining)和MP(Maximum parsimony)方法都可以，當然還有其他很多方法，依據不同標准，需求選擇
10.調好參數，計算就可以了
問題五：怎麼對mega構建的系統進化樹分析 我是只能看出來親緣關系的遠近
問題六：做了一個系統進化樹，請問怎麼分析 首先你需要一個能夠對序列進行編輯的軟體（比如Mac系統的MacGDE、WIndows的BioEdit、Mega、Genuis、ClusterX等）對整個資料庫排序（Alignment）,就是把相似的位點放到一起去.
同時你要決定構建樹用的方法,一般來說用Maximum Likelihood（Paup）、Bayesian（Mr Bayes）,不過在此之前先用Neibour-Joining（快速,不準確）看一看大概情況也是必要的
然後就是把資料庫里有Gap的部分切掉,然後放到構建樹的程序（Paup、MrBayes等）去做樹
具體方法見那些軟體的說明書……
問題七：如何分析SNP，做進化樹 1.TaqMan探針法針對染色體上的不同SNP位點分別設計PCR引物和TaqMan探針，進行實時熒光PCR擴增。探針的5』-端和3』-端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。當溶液中存在PCR產物時，該探針與模板退火，即產生了適合於核酸外切酶活性的底物，從而將探針5』-端連接的熒光分子從探針上切割下來，破壞兩熒光分子間的PRET，發出熒光。通常用於少量SNP位點分析。
2.SNaPshot法該技術由美國應用生物公司（ABI）開發，是基於熒游標記單鹼基延伸原理的分型技術，也稱小測序，主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒游標記ddNTP、緊臨多態位點5』-端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中，引物延伸一個鹼基即終止，經ABI測序儀檢測後，根據峰的移動位置確定該延伸產物對應的SNP位點，根據峰的顏色可得知摻入的鹼基種類，從而確定該樣本的基因型。對於PCR產物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。通常用於10-30個SNP位點分析。